15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2623 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2623  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  417  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2628  hypothetical protein  43.96 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  37.34 
 
 		 340 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0382  hypothetical protein  39.88 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225555  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  26.32 
 
 		 460 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  25.97 
 
 		 653 aa  52  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0404  levanase  32 
 
 		 1267 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.21 
 
 		 1655 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1526  hypothetical protein  34.15 
 
 		 525 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3792  Levanase  28.71 
 
 		 1220 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  31.9 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.71 
 
 		 1444 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0947  hypothetical protein  32.93 
 
 		 730 aa  42  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  27.27 
 
 		 221 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2227  hypothetical protein  32.61 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>