62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0555 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  84.41 
 
 		 1708 aa  863    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  100 
 
 		 1597 aa  3142    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  55.49 
 
 		 1746 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  50.57 
 
 		 1059 aa  465  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  48.87 
 
 		 1332 aa  436  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  48.87 
 
 		 1159 aa  430  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  52.3 
 
 		 793 aa  226  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  31.82 
 
 		 433 aa  94.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  32.37 
 
 		 318 aa  93.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  33.47 
 
 		 369 aa  91.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0809  laminin G, domain-containing 2  40.5 
 
 		 209 aa  88.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.012094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  32.22 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  31.62 
 
 		 339 aa  81.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  32.07 
 
 		 309 aa  80.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  31.31 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  26.87 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  29.76 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_89632  predicted protein  30.36 
 
 		 357 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.730848  hitchhiker  0.00000161673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  26.55 
 
 		 315 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2928  hypothetical protein  31.47 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000841145  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.51 
 
 		 4357 aa  65.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  33.89 
 
 		 1265 aa  61.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2223 aa  60.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.41 
 
 		 6678 aa  58.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1054 aa  57.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  29.72 
 
 		 786 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  28.19 
 
 		 304 aa  57  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3449  hypothetical protein  30.98 
 
 		 491 aa  53.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  48.81 
 
 		 942 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  56.1 
 
 		 1394 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  25.2 
 
 		 307 aa  53.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  25.12 
 
 		 309 aa  53.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  25.58 
 
 		 307 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  29.81 
 
 		 319 aa  52.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  24.28 
 
 		 3907 aa  52.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  26.11 
 
 		 756 aa  52  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  26.11 
 
 		 756 aa  52  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.87 
 
 		 11716 aa  51.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2559  hypothetical protein  28.76 
 
 		 297 aa  52  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  26.11 
 
 		 756 aa  52  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.85 
 
 		 598 aa  50.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  24.55 
 
 		 319 aa  49.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  25.34 
 
 		 311 aa  49.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  23.78 
 
 		 2503 aa  48.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.71 
 
 		 304 aa  48.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  32.08 
 
 		 331 aa  48.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  25.88 
 
 		 531 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.87 
 
 		 754 aa  48.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 846 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  23.78 
 
 		 3699 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  34.62 
 
 		 294 aa  47.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  24.66 
 
 		 319 aa  47.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  25.58 
 
 		 1067 aa  46.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  38.83 
 
 		 633 aa  46.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  28.45 
 
 		 1091 aa  46.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.24 
 
 		 3699 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  23.48 
 
 		 328 aa  45.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43831  predicted protein  23.08 
 
 		 450 aa  45.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1367 aa  45.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  26.94 
 
 		 1537 aa  45.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4320  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.63 
 
 		 330 aa  45.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327535  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  23.01 
 
 		 2334 aa  45.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>