229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2820 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 633 aa  1295    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  64.68 
 
 		 619 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  64.76 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  58.85 
 
 		 1414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  63.37 
 
 		 649 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  61.93 
 
 		 658 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  61.94 
 
 		 580 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  58.41 
 
 		 526 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  50.57 
 
 		 566 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  52.73 
 
 		 468 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  49.78 
 
 		 534 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  50.5 
 
 		 660 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  45.39 
 
 		 563 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  45 
 
 		 539 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.31 
 
 		 2305 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  36.68 
 
 		 562 aa  226  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  35.73 
 
 		 608 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  35.16 
 
 		 2310 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  35.68 
 
 		 542 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  48.29 
 
 		 854 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  30.53 
 
 		 480 aa  160  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  32.14 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  42.33 
 
 		 455 aa  140  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  48.94 
 
 		 1128 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  29.92 
 
 		 614 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  58.04 
 
 		 609 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  58.82 
 
 		 596 aa  127  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.62 
 
 		 984 aa  127  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  61.17 
 
 		 588 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  55.56 
 
 		 812 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  47.44 
 
 		 842 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  40.31 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.94 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  48.78 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.05 
 
 		 773 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  49.06 
 
 		 846 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  50.49 
 
 		 894 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.44 
 
 		 743 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  53.92 
 
 		 628 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.7 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.65 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  44.86 
 
 		 746 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  49.52 
 
 		 495 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.13 
 
 		 669 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  37.67 
 
 		 974 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  39.39 
 
 		 744 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 774 aa  103  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  41.18 
 
 		 681 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  41.73 
 
 		 605 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.64 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.06 
 
 		 469 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  46.67 
 
 		 913 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 		 963 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 1055 aa  100  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  46.08 
 
 		 518 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  46.96 
 
 		 942 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  38.85 
 
 		 966 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  40.13 
 
 		 767 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 688 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  44.23 
 
 		 494 aa  97.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  42.34 
 
 		 543 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  42.72 
 
 		 778 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  45.61 
 
 		 785 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  45.19 
 
 		 436 aa  95.1  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  45.71 
 
 		 775 aa  94.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  44.54 
 
 		 694 aa  94.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  42.99 
 
 		 459 aa  94  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.48 
 
 		 979 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  39.17 
 
 		 420 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 934 aa  92.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  46.73 
 
 		 1042 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  46.67 
 
 		 935 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  38.64 
 
 		 485 aa  90.9  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  48.54 
 
 		 389 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  46.15 
 
 		 487 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.53 
 
 		 393 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  24.84 
 
 		 725 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 906 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  26.25 
 
 		 632 aa  88.6  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  42.19 
 
 		 589 aa  88.2  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  40.94 
 
 		 620 aa  87.4  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  42.34 
 
 		 727 aa  87  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  47.75 
 
 		 829 aa  87  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  42.57 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  36.75 
 
 		 794 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  39.01 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.31 
 
 		 925 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  41.18 
 
 		 623 aa  85.9  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 842 aa  85.1  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  47.13 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  47.78 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  38.35 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.18 
 
 		 875 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  48.84 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  41.9 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  39.81 
 
 		 990 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>