24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2260 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  62.25 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0433  hypothetical protein  41.01 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.233515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  25.76 
 
 		 1708 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  28.4 
 
 		 1597 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  26.59 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  27.53 
 
 		 561 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  25.56 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  25.47 
 
 		 1746 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  25.43 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  29.05 
 
 		 675 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  23.64 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  28.36 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  33.33 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  25 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2657  hypothetical protein  29.27 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000214903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4907  hypothetical protein  43.86 
 
 		 825 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000428379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  25.56 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4320  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  24.86 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327535  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  21.7 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  34.07 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1332 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1059 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>