46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7035 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  100 
 
 
338 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3850  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  57.41 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183549  normal  0.803751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7054  glycosyl hydrolase family 32 protein  56.41 
 
 
347 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  46.62 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0229  glycosyl hydrolase family 32 protein  36.61 
 
 
330 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  37.36 
 
 
210 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0224  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.03 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.851243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3966  glycosyl hydrolase family 32 protein  35.42 
 
 
505 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.953512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.08 
 
 
491 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.72 
 
 
499 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  32.97 
 
 
523 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7710  hypothetical protein  46.15 
 
 
183 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  38.94 
 
 
511 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  32.21 
 
 
740 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2657  hypothetical protein  33.06 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000214903  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  29.96 
 
 
473 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.94 
 
 
705 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  25.22 
 
 
491 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  26.92 
 
 
491 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4624  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.31 
 
 
477 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  29.29 
 
 
471 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.37 
 
 
491 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.37 
 
 
491 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.37 
 
 
491 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.85 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.31 
 
 
469 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.1 
 
 
481 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  27.62 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.83 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  31.78 
 
 
492 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  29.43 
 
 
480 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.7 
 
 
491 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  32.05 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.43 
 
 
787 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.27 
 
 
464 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  29.2 
 
 
1746 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  32.81 
 
 
545 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.85 
 
 
1418 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  32.81 
 
 
545 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  32.81 
 
 
545 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  26.8 
 
 
451 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.81 
 
 
493 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  28.85 
 
 
497 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  34.31 
 
 
476 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  23.83 
 
 
421 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.44 
 
 
566 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>