60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7054 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7054  glycosyl hydrolase family 32 protein  100 
 
 
347 aa  692    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3850  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  56.78 
 
 
319 aa  338  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183549  normal  0.803751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  55.45 
 
 
338 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  47.42 
 
 
331 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0229  glycosyl hydrolase family 32 protein  37.35 
 
 
330 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.26 
 
 
210 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3966  glycosyl hydrolase family 32 protein  31.48 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.953512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0224  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.94 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.851243  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  35.36 
 
 
705 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.67 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  33.33 
 
 
492 aa  67  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.86 
 
 
481 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2493  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  37.02 
 
 
787 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.75 
 
 
454 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.73 
 
 
491 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  25 
 
 
491 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.87 
 
 
491 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  25 
 
 
491 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  27.37 
 
 
491 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  29.8 
 
 
471 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  27.37 
 
 
491 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7710  hypothetical protein  47.83 
 
 
183 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.67 
 
 
491 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.48 
 
 
493 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0758  sucrose-6-phosphate hydrolase  31.37 
 
 
493 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713139  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1307  Beta-fructofuranosidase  24.39 
 
 
432 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1379  Beta-fructofuranosidase  24.39 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  32.73 
 
 
480 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  28.91 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  29.78 
 
 
740 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  25.1 
 
 
473 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0056  glycosyl hydrolase family 32 protein  31.6 
 
 
415 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  25 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.4 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3594  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.69 
 
 
480 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2649  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.81 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0433  hypothetical protein  31.82 
 
 
342 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.233515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  29.48 
 
 
480 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  24.72 
 
 
532 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  33.04 
 
 
1746 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1783  sucrose-6-phosphate dehydrogenase  21.62 
 
 
487 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1873  levanase  28.23 
 
 
557 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.21 
 
 
523 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  25.45 
 
 
421 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.27 
 
 
545 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3268  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.39 
 
 
464 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2296  hypothetical protein  26.34 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2758  hypothetical protein  27.49 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00648558  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15480  hypothetical protein  37.68 
 
 
508 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.857136  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.27 
 
 
469 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4097  levanase  27.98 
 
 
545 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  33.64 
 
 
511 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  31.25 
 
 
754 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3248  levanase  29.95 
 
 
545 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155221  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.27 
 
 
469 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  24.9 
 
 
451 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4269  levanase  29.95 
 
 
545 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0643119  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3140  glycosyl hydrolase family 32 protein  36 
 
 
476 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3697  levanase  29.44 
 
 
572 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  29.33 
 
 
385 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>