17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15480  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1017    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.857136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5251  hypothetical protein  59.64 
 
 		 503 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28553  normal  0.12829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  37.74 
 
 		 1746 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  36.76 
 
 		 331 aa  50.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 343 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  32.18 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  29.17 
 
 		 294 aa  47.4  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  30.51 
 
 		 328 aa  47  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  38.16 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  31.82 
 
 		 675 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  29.06 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  38.2 
 
 		 561 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7054  glycosyl hydrolase family 32 protein  37.68 
 
 		 347 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  40.4 
 
 		 310 aa  43.9  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  36.36 
 
 		 724 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  28.22 
 
 		 1708 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>