90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2615 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 		 724 aa  1451    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  65.21 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  65.12 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  40.18 
 
 		 296 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  39.09 
 
 		 294 aa  218  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  41.64 
 
 		 302 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  39.88 
 
 		 296 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  39.29 
 
 		 296 aa  213  9e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  35.96 
 
 		 297 aa  191  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  39.29 
 
 		 357 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  30.79 
 
 		 332 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  30.05 
 
 		 359 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  37.42 
 
 		 354 aa  171  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  35.91 
 
 		 316 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  37.09 
 
 		 318 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  42.39 
 
 		 329 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  39.17 
 
 		 317 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  34.1 
 
 		 1178 aa  162  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  36.76 
 
 		 330 aa  161  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  37.97 
 
 		 319 aa  160  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  36.69 
 
 		 320 aa  157  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  39.77 
 
 		 349 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  35.85 
 
 		 351 aa  154  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  35.85 
 
 		 351 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  35.85 
 
 		 351 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  34.04 
 
 		 328 aa  154  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  36.12 
 
 		 355 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  34.81 
 
 		 352 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  38.08 
 
 		 320 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  34.02 
 
 		 343 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  43.02 
 
 		 180 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  35.19 
 
 		 338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  29.97 
 
 		 328 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  33.83 
 
 		 352 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  33.02 
 
 		 344 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  33.33 
 
 		 312 aa  137  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  35 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  35.34 
 
 		 331 aa  135  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  37.24 
 
 		 328 aa  134  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  37.71 
 
 		 491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  36.5 
 
 		 326 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  36.5 
 
 		 326 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  33.96 
 
 		 318 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  34.44 
 
 		 340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  35.29 
 
 		 321 aa  128  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  34.47 
 
 		 336 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  36.14 
 
 		 496 aa  126  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  35.62 
 
 		 332 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  34.22 
 
 		 329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  29.18 
 
 		 323 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  35.68 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  33.62 
 
 		 433 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  34.82 
 
 		 433 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  36.4 
 
 		 494 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  33.79 
 
 		 481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  31.16 
 
 		 714 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  32.4 
 
 		 430 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  32.03 
 
 		 492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  34.74 
 
 		 496 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  32.66 
 
 		 340 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  36.68 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  27.11 
 
 		 382 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  31.22 
 
 		 488 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32.37 
 
 		 353 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  34.51 
 
 		 440 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  27.58 
 
 		 345 aa  104  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  35.71 
 
 		 376 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  33.04 
 
 		 490 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  27.84 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  32.03 
 
 		 363 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  31.15 
 
 		 505 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  34.09 
 
 		 373 aa  99  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  33.71 
 
 		 373 aa  97.8  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  29.96 
 
 		 490 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  30.95 
 
 		 367 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  27.17 
 
 		 342 aa  95.1  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  27.66 
 
 		 374 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  27.67 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  25.18 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  27.01 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  25.6 
 
 		 425 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  25.26 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  26.24 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.15 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  34.23 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  25.08 
 
 		 334 aa  55.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  25.08 
 
 		 334 aa  55.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  41.38 
 
 		 561 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  27.54 
 
 		 379 aa  51.2  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>