87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0544 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
506 aa  994    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  54.74 
 
 
494 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  46.96 
 
 
505 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  47.64 
 
 
496 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  46.61 
 
 
491 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  43.2 
 
 
490 aa  359  8e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  37.73 
 
 
492 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  39.87 
 
 
496 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  40.28 
 
 
489 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  36.74 
 
 
481 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  37.34 
 
 
488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  36.46 
 
 
490 aa  316  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  37.25 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  36.51 
 
 
433 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  49.79 
 
 
437 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  47.62 
 
 
440 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  43.53 
 
 
430 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  30.9 
 
 
352 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  34.53 
 
 
296 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  35.45 
 
 
354 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  28.7 
 
 
355 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  32.05 
 
 
351 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  32.05 
 
 
351 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  32.72 
 
 
297 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  32.05 
 
 
351 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  30.14 
 
 
302 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  30.8 
 
 
294 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  32.27 
 
 
343 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  30.49 
 
 
352 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  36.43 
 
 
180 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  32.19 
 
 
316 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  31.25 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  32.24 
 
 
329 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  29.39 
 
 
296 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  29.39 
 
 
296 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  30.18 
 
 
355 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  29.13 
 
 
1178 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  34.41 
 
 
326 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  26.97 
 
 
332 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  34.41 
 
 
326 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  30.8 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  34.32 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  34.08 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  33.33 
 
 
724 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  30.87 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  36.42 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  25.45 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  31.4 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  34.32 
 
 
318 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  30.74 
 
 
317 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  29.96 
 
 
330 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 
336 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  30.64 
 
 
320 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  37.11 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  34.73 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  32.12 
 
 
312 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  31.42 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  28.95 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  33.53 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  38.53 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  32.93 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  32.72 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  32.76 
 
 
714 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  29.1 
 
 
400 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  34.62 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  27.04 
 
 
318 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.28 
 
 
385 aa  60.1  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  33.33 
 
 
353 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  30.43 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  27.98 
 
 
425 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  27.03 
 
 
328 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  34.95 
 
 
396 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  31.07 
 
 
395 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  31.34 
 
 
373 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  24.88 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  28.57 
 
 
370 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  30.56 
 
 
323 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  24.74 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  29.22 
 
 
342 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  27.66 
 
 
367 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  27.12 
 
 
379 aa  50.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  28.57 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  27.59 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  26.4 
 
 
393 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  24.51 
 
 
364 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  25.41 
 
 
374 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>