88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1054 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  81.22 
 
 
491 aa  798    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  100 
 
 
496 aa  998    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  50.62 
 
 
505 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  47.64 
 
 
506 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  47.25 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  42.68 
 
 
496 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  45.01 
 
 
490 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  43.85 
 
 
489 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  41.08 
 
 
492 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  41.58 
 
 
481 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  41.48 
 
 
433 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  44.21 
 
 
490 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  39.59 
 
 
488 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  40.37 
 
 
433 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  40.53 
 
 
437 aa  339  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  37.32 
 
 
430 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  50.65 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  35.24 
 
 
296 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  33.21 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  34.73 
 
 
296 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  34.73 
 
 
296 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  38.21 
 
 
343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  35.14 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  32.35 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  36.14 
 
 
724 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  33.95 
 
 
302 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  33.04 
 
 
352 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  41.43 
 
 
180 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  36.84 
 
 
329 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  35.27 
 
 
316 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  36.32 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  30.94 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  35.02 
 
 
349 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  33.19 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  33.19 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  33.19 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  30.71 
 
 
1178 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  31.03 
 
 
320 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  36.28 
 
 
326 aa  106  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  35.22 
 
 
319 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  36.28 
 
 
326 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  28.79 
 
 
332 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  35.53 
 
 
317 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  31.42 
 
 
352 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  32.79 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  31.62 
 
 
330 aa  97.8  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  33.95 
 
 
338 aa  97.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 
320 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  29.78 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  34.02 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  35.1 
 
 
318 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  30.8 
 
 
344 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  33.94 
 
 
336 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  32.73 
 
 
318 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  32.91 
 
 
328 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  33.18 
 
 
312 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  35.05 
 
 
332 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  34.68 
 
 
328 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  31.6 
 
 
321 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  34.4 
 
 
331 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  35.77 
 
 
714 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  39.2 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  33.71 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.35 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  31.82 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  29.57 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  29.87 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  38.53 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  32.68 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  29.96 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  35.04 
 
 
353 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  28.57 
 
 
376 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  27.82 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  27.64 
 
 
425 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  25.63 
 
 
395 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  24.9 
 
 
382 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  25.79 
 
 
394 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  39.13 
 
 
307 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  23.37 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  28 
 
 
379 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  26.89 
 
 
364 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  23.91 
 
 
396 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  27.04 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  29.25 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  25.9 
 
 
342 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  24.04 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  26.05 
 
 
334 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  26.05 
 
 
334 aa  44.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>