99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1919 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  100 
 
 
1178 aa  2415    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  41.03 
 
 
714 aa  231  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  44.97 
 
 
294 aa  227  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  45.33 
 
 
296 aa  226  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  45 
 
 
296 aa  224  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  41.75 
 
 
302 aa  215  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  38.71 
 
 
296 aa  196  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  37.22 
 
 
297 aa  193  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  36.21 
 
 
343 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  35.44 
 
 
329 aa  162  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  34.1 
 
 
724 aa  161  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  37.3 
 
 
316 aa  161  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  39.18 
 
 
351 aa  151  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  39.18 
 
 
351 aa  151  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  39.18 
 
 
351 aa  151  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  35.58 
 
 
330 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  37.69 
 
 
355 aa  149  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  38.1 
 
 
352 aa  149  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  32.15 
 
 
332 aa  149  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  31.7 
 
 
359 aa  148  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  33.44 
 
 
328 aa  147  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  32.9 
 
 
328 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  31.45 
 
 
320 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  31.72 
 
 
320 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  31.46 
 
 
345 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  43.98 
 
 
180 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  31.6 
 
 
317 aa  131  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  35 
 
 
355 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  34.55 
 
 
373 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32.49 
 
 
353 aa  129  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  32.86 
 
 
354 aa  128  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  30.64 
 
 
349 aa  126  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  31.13 
 
 
318 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  31.01 
 
 
323 aa  123  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  33.85 
 
 
352 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  35.32 
 
 
326 aa  122  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  32.92 
 
 
319 aa  121  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  34.92 
 
 
326 aa  119  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  32.99 
 
 
357 aa  119  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  36.44 
 
 
338 aa  118  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  31.1 
 
 
364 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  31.05 
 
 
496 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  31.22 
 
 
373 aa  112  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  32.65 
 
 
340 aa  111  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  30.71 
 
 
496 aa  110  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  32.71 
 
 
318 aa  110  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  33.47 
 
 
321 aa  110  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  31.55 
 
 
376 aa  108  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  31.37 
 
 
332 aa  108  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  29.49 
 
 
363 aa  106  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  29.27 
 
 
430 aa  105  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  30.2 
 
 
491 aa  105  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  34.45 
 
 
489 aa  104  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  28.96 
 
 
433 aa  104  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  33.05 
 
 
488 aa  104  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  30.49 
 
 
312 aa  103  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  30.49 
 
 
433 aa  103  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  35.58 
 
 
481 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  30.03 
 
 
328 aa  102  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  29.74 
 
 
342 aa  102  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  28.69 
 
 
382 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  29.74 
 
 
494 aa  99.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  29.39 
 
 
374 aa  98.6  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  35.75 
 
 
336 aa  97.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  26.97 
 
 
490 aa  95.5  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  31.84 
 
 
492 aa  95.1  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  28.16 
 
 
329 aa  95.1  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  28.45 
 
 
505 aa  94.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  28.63 
 
 
440 aa  94.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  33.48 
 
 
331 aa  94  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  28.74 
 
 
437 aa  92  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  27.49 
 
 
343 aa  92  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0186  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
404 aa  90.9  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236135  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  26.65 
 
 
340 aa  90.9  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1589  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 
380 aa  89.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0747672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  29.13 
 
 
506 aa  89  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.79 
 
 
385 aa  88.2  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  31.05 
 
 
490 aa  87.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  26.37 
 
 
370 aa  86.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1540  glycosyl transferase family protein  21.66 
 
 
380 aa  83.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0303814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2964  hypothetical protein  23.98 
 
 
410 aa  84  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.931605  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0071  glycosyl transferase family protein  21.8 
 
 
393 aa  83.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  26.52 
 
 
400 aa  82  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  26.57 
 
 
396 aa  81.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  27.21 
 
 
393 aa  79  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  25.51 
 
 
396 aa  79  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  27.92 
 
 
395 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  26.46 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  23.95 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3199  hypothetical protein  22.27 
 
 
410 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2999  hypothetical protein  22.66 
 
 
407 aa  69.7  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3098  hypothetical protein  22.27 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5025  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
408 aa  65.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  25.36 
 
 
367 aa  63.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
389 aa  51.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
510 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  33.68 
 
 
561 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
388 aa  44.7  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>