46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1540 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1589  glycosyl transferase family protein  93.42 
 
 
380 aa  736    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0747672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1540  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
380 aa  776    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0303814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0071  glycosyl transferase family protein  55.41 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0186  glycosyl transferase family protein  33.25 
 
 
404 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236135  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5025  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 
408 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2964  hypothetical protein  24.94 
 
 
410 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.931605  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2999  hypothetical protein  26.07 
 
 
407 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3098  hypothetical protein  24.19 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3199  hypothetical protein  26.13 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  21.66 
 
 
1178 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.23 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
316 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.85 
 
 
324 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.82 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1138  hypothetical protein  25.81 
 
 
352 aa  56.2  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
510 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
213 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
228 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
206 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  32.59 
 
 
260 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.32 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
293 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.38 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.38 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.38 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
226 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
229 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
229 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.15 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.8 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 
227 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
344 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
253 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.34 
 
 
220 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
246 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
346 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.38 
 
 
252 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
250 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>