86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5322 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  100 
 
 		 437 aa  904    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  67.52 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  63.49 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  50.47 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  46.74 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  39.92 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  40.53 
 
 		 496 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  58.72 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  53.53 
 
 		 496 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  53.62 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  51.26 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  53.1 
 
 		 481 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  54.2 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  50.85 
 
 		 491 aa  252  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  49.79 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  46.38 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  50.23 
 
 		 494 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  33.14 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  27.5 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  33.47 
 
 		 297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  31.58 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  32.35 
 
 		 296 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  32.27 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  34.62 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  32.22 
 
 		 296 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  32.22 
 
 		 296 aa  123  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  37.14 
 
 		 354 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  36.49 
 
 		 316 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  32.19 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  32.19 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  32.19 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  32.03 
 
 		 349 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  35.68 
 
 		 724 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  29.82 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  40 
 
 		 180 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  31.82 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  29.91 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  32.33 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  33.75 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  33.08 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  37.43 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  35.1 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  33.76 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  31.85 
 
 		 357 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  31.39 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  32.14 
 
 		 318 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  32.91 
 
 		 326 aa  97.8  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  29 
 
 		 319 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  32.46 
 
 		 312 aa  96.7  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  30.42 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  34.13 
 
 		 318 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  36.31 
 
 		 321 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  29.57 
 
 		 1178 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  34.29 
 
 		 328 aa  90.9  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  28.52 
 
 		 320 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  36.04 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  26.49 
 
 		 332 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  25 
 
 		 359 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  27.65 
 
 		 714 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  32.18 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  26.69 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  29.24 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  26.6 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  27.17 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  28.29 
 
 		 370 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  28.03 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  27.15 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  27.14 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  27.42 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  38.24 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  34.26 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  28.86 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  27.64 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  23.66 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  25.5 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  26.69 
 
 		 345 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  27.6 
 
 		 379 aa  57  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  22.22 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  24.89 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  24.12 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  35.56 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  24.27 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  23.08 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  21.72 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  25 
 
 		 364 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>