85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5605 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 481 aa  999    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  48.97 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  48.54 
 
 		 492 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  48.76 
 
 		 490 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  48 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  45.57 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  45.28 
 
 		 489 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  41.84 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  38.78 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  39.06 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  39.22 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  36.81 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  37.04 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  36.01 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  51.25 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  48.47 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  45.45 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  37.93 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  37.12 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  36.24 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  37.12 
 
 		 351 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  37.12 
 
 		 351 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  37.44 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  37.29 
 
 		 296 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  37.29 
 
 		 296 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  32.9 
 
 		 352 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  35.48 
 
 		 296 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  36.87 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  36.11 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  33.33 
 
 		 332 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  32.65 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  34.89 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  32.77 
 
 		 724 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  31.76 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  42.14 
 
 		 180 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  31.82 
 
 		 349 aa  113  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  34.55 
 
 		 329 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  36.21 
 
 		 320 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  34.71 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  31.83 
 
 		 359 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  35.65 
 
 		 330 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  32.31 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  34.29 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  37.1 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  35.32 
 
 		 344 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  31.73 
 
 		 1178 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  34.07 
 
 		 318 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  36.32 
 
 		 326 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  37.43 
 
 		 338 aa  100  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  38.69 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  33.48 
 
 		 319 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  37.28 
 
 		 336 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  35.1 
 
 		 332 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  36.84 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  36.78 
 
 		 318 aa  93.2  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  31.3 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  37.14 
 
 		 328 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  37.06 
 
 		 331 aa  87.8  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  29.82 
 
 		 340 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  34.78 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  32.79 
 
 		 370 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  30.38 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  32.4 
 
 		 714 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  34.45 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.61 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  30.09 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  34.68 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  26.34 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  40.22 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  27.69 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  27.83 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27.92 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  28.76 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  39.29 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  25.76 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  27.76 
 
 		 323 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  27.46 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  23.86 
 
 		 374 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  27.69 
 
 		 343 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  25.64 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  25.09 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  33.33 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  36.84 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  23.98 
 
 		 342 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>