17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2570 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  45.12 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  39.29 
 
 		 481 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  37.76 
 
 		 430 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  39.13 
 
 		 496 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  39.13 
 
 		 491 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  36.9 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  36.67 
 
 		 433 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  40 
 
 		 494 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  35.63 
 
 		 440 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  35.8 
 
 		 437 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  39.19 
 
 		 433 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  36.05 
 
 		 492 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  41.89 
 
 		 505 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  34.48 
 
 		 490 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  37.65 
 
 		 488 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  32.69 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>