84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0741 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  100 
 
 
430 aa  890    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  59.76 
 
 
440 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  49.41 
 
 
433 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  48.7 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  46.74 
 
 
437 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  40.58 
 
 
490 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  38 
 
 
496 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  34.86 
 
 
488 aa  299  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  38.28 
 
 
505 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  37.32 
 
 
496 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  34.62 
 
 
492 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  36.94 
 
 
494 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  36.17 
 
 
489 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  46.75 
 
 
481 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  44.83 
 
 
490 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  47.14 
 
 
491 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  43.53 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  34.39 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  34.18 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  33.64 
 
 
297 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  34.5 
 
 
349 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  35.48 
 
 
302 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  35.62 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  34.19 
 
 
354 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  32.74 
 
 
294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  32.4 
 
 
724 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  35.9 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  29.06 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 
351 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  30.85 
 
 
330 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  31.58 
 
 
316 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  33.62 
 
 
296 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  33.19 
 
 
296 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  32.91 
 
 
344 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  32.48 
 
 
355 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  29.27 
 
 
1178 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  30.43 
 
 
352 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  31.3 
 
 
320 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  38.57 
 
 
180 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  32.3 
 
 
352 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  27.67 
 
 
332 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  33.68 
 
 
326 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  31.88 
 
 
318 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  34.46 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  31.88 
 
 
338 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  33.16 
 
 
326 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  35.83 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  32.7 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  33.98 
 
 
340 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  29.71 
 
 
320 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  30.99 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  28.99 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  32.46 
 
 
328 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  31.82 
 
 
714 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  32.03 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  30.88 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  32.75 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  41.53 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  31.76 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.69 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  31.53 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  30.92 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  37.31 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  29.26 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  29.41 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  26.01 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  28.57 
 
 
329 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  28.33 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  27.4 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  26.36 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  27.38 
 
 
343 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  23.14 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  24.23 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  37.76 
 
 
307 aa  56.6  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  25.14 
 
 
393 aa  56.6  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  29.3 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  25.79 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  24.02 
 
 
396 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 
394 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  24.14 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  23.14 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  38.1 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>