82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3437 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 
340 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  49.84 
 
 
320 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  50.83 
 
 
317 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  48.69 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  43.69 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  38.96 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  38.61 
 
 
316 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  38.44 
 
 
344 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  36.48 
 
 
320 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  36.81 
 
 
318 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  31.86 
 
 
336 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  30.56 
 
 
326 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  32.25 
 
 
340 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  30.74 
 
 
294 aa  142  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  30.57 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  33.59 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  33.59 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  33.59 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  35.38 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  28.95 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  29.65 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  31.4 
 
 
352 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  30.46 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  32.68 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  36.19 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  30.74 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  34.39 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  29 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  30.95 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  30.42 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  30.97 
 
 
318 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  29.24 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  27.81 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  31.92 
 
 
355 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  30.97 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  27.78 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  32.66 
 
 
724 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  33.55 
 
 
328 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  27.34 
 
 
296 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  27.31 
 
 
302 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  29.27 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  32.8 
 
 
180 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  26.65 
 
 
1178 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  25.29 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  23.78 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  23.91 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  27.04 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  27.07 
 
 
496 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  29.26 
 
 
430 aa  72.8  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  29.87 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  28.99 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  30.17 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  26.42 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  27.63 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  26.32 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  26.11 
 
 
433 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  24.55 
 
 
353 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  23.34 
 
 
400 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  26.42 
 
 
382 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  29.61 
 
 
714 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  22.44 
 
 
396 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  25.75 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  29.9 
 
 
491 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  25.31 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  22.57 
 
 
385 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  27.11 
 
 
488 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  24.89 
 
 
437 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  23.95 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  28.25 
 
 
494 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  27.06 
 
 
481 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  28.51 
 
 
489 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  24.45 
 
 
323 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  21.71 
 
 
395 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  28.19 
 
 
505 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  26.18 
 
 
492 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  27.59 
 
 
506 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  22.36 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  22.6 
 
 
393 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  21.33 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  23.08 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  22.11 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  21.69 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>