87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4004 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 352 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  72.21 
 
 		 355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  46.05 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  45.82 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  46.99 
 
 		 349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  45.4 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  41.26 
 
 		 351 aa  278  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  41.26 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  41.26 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  43.02 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  42.34 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  40.39 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  39.53 
 
 		 297 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  39.76 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  33.89 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  35.52 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  34.46 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  35.71 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  36.43 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  38.34 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  34.75 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  37.45 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  37.07 
 
 		 296 aa  159  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  37.15 
 
 		 344 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  37.07 
 
 		 296 aa  159  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  39.27 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  39.27 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  35.94 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  34.77 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  33.83 
 
 		 724 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  42.2 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  43.71 
 
 		 180 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  37.9 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  33.72 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  31.47 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  31.93 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  34.21 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  38.36 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  32.18 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  30.95 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  36.99 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  36.57 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  33.85 
 
 		 1178 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  36.99 
 
 		 331 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  34.88 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  31.76 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  34.68 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 433 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  36.61 
 
 		 489 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  29.91 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  31.7 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  32.3 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  33.49 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  31.42 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  30.49 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  32.06 
 
 		 488 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  30.6 
 
 		 714 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  28.61 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  31.36 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  31.42 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  30.09 
 
 		 491 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  33.78 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  28.77 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  26.95 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  26.07 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  35.53 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  30.09 
 
 		 494 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  28.09 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  28.83 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  27.7 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  27.24 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  26.39 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  27.03 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  27.82 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  26.15 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  25.52 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  25.44 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  26.1 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  25.34 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  24.53 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  25.53 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  26.44 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  25.85 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  28.5 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  34.91 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  24.25 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>