77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3919 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 
364 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  46.2 
 
 
382 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  44.08 
 
 
374 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  42.74 
 
 
367 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  43.55 
 
 
328 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  38.19 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  37.9 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  41.64 
 
 
328 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  38.29 
 
 
342 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  33.88 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  34.21 
 
 
296 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  33.88 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  31.73 
 
 
297 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  30.21 
 
 
296 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  29.79 
 
 
332 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  29.45 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  31.1 
 
 
1178 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  30.38 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  31.67 
 
 
317 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  30.03 
 
 
359 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  28.86 
 
 
329 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  27.3 
 
 
343 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  27.35 
 
 
561 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  29.93 
 
 
330 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  27.84 
 
 
724 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  29.39 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  29.26 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  29.64 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  29.74 
 
 
319 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  27.39 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  29.22 
 
 
343 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  28.18 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  28.04 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  29.79 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  26.26 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  27.01 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  27.01 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  27.01 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  27.08 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  27.17 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  26.4 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  26.06 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  27.03 
 
 
714 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  25.16 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  26.06 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  25.24 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  25.52 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  26.22 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  24.04 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  26.27 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  26.86 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  26.29 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  27.06 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  25.57 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  26.51 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  28.33 
 
 
433 aa  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  24.58 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  27.27 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  25.8 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  26.32 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  26.89 
 
 
491 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  26.81 
 
 
496 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  23.18 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  26.89 
 
 
496 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  24.08 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32 
 
 
353 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  25.21 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_89632  predicted protein  30.17 
 
 
357 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.730848  hitchhiker  0.00000161673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  24.69 
 
 
494 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  24.51 
 
 
506 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2758  hypothetical protein  28.18 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00648558  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  30.08 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.7 
 
 
385 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  21.69 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  25 
 
 
437 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  26.27 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  22.22 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>