60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1008 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  775    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  32.36 
 
 
352 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  30.56 
 
 
355 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  26.38 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  28.61 
 
 
352 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  30.95 
 
 
296 aa  96.7  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  30.16 
 
 
296 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  31.05 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  30.3 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  29.06 
 
 
351 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  29.06 
 
 
351 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  29.06 
 
 
351 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  29.01 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  29.52 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  29.02 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  29.44 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  28.14 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  29.12 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  31.77 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  28.02 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  30.19 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  28.17 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  28.5 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  27.03 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  25.69 
 
 
328 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  26.42 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  25.19 
 
 
328 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  26.29 
 
 
344 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  30.8 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  26.77 
 
 
316 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  25.21 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  27.01 
 
 
494 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  27.6 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  25.35 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  28.33 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  28 
 
 
496 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  34.65 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  28.88 
 
 
491 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  24.08 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  26.15 
 
 
496 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  27.54 
 
 
724 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  26.67 
 
 
490 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  29.32 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  27.12 
 
 
506 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  24.43 
 
 
492 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  29.61 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  36.75 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  29.05 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  25.38 
 
 
312 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  23.9 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  38.1 
 
 
430 aa  46.2  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  26.7 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  35.71 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  26.94 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  24.7 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  25.48 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  23.74 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  28.37 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  34.17 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  22.62 
 
 
382 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>