93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0362 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 		 343 aa  688    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  65.12 
 
 		 724 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  41.59 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  37.96 
 
 		 296 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  40.61 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  40 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  35.31 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  37.46 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  34.44 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  36.21 
 
 		 1178 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  38.58 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  39.66 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  38.84 
 
 		 319 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  41.29 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  37.97 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  39.01 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  37.99 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  32.22 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  37.73 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  37.73 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  37.73 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  38.07 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  38.9 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  38.05 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  35.26 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  37.73 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  34.09 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  38.34 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  36.04 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  35.34 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  32.72 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  35.77 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  38.64 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  36.47 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  34.54 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  42.94 
 
 		 180 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  33.14 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  34.21 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  37.1 
 
 		 433 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  38.17 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  35.85 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  34.96 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  34.21 
 
 		 496 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  30.86 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  31.83 
 
 		 714 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  38.21 
 
 		 496 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  35.19 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  34.39 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  35.21 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  34.39 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  33.09 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  36.03 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  32.83 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  35.92 
 
 		 490 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  33.95 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  38.84 
 
 		 489 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  35.1 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  35.25 
 
 		 440 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  32.94 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  30.7 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  32.48 
 
 		 481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  32.93 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  31.56 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  34.21 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  33.47 
 
 		 505 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  31.45 
 
 		 490 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  27 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  32.27 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  27.38 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  27.58 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  28.96 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  32.86 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  31.91 
 
 		 494 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  33.95 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  34.18 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  30.32 
 
 		 367 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  29.01 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  24.57 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.56 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  24.56 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  25.53 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  26.5 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  25.62 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  30.19 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  25.43 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  24.63 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  24.37 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  27.4 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  24.07 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  24.07 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  22.73 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0696  hypothetical protein  24.32 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  0.0673528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1153  glycosidase, PH1107-related  23.69 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0153392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>