90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3139 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  709    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  78.12 
 
 		 320 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  58.28 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  53.35 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  55.08 
 
 		 329 aa  352  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  50.49 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  47.25 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  46.56 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  47.88 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  38.44 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  37.7 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  36.79 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  34.69 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  39.85 
 
 		 355 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  34.52 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  39.92 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  38.08 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  34.94 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  38.67 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  34.5 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  38.24 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  35 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  38.05 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  35.78 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  37.5 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  37.46 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  37.5 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  37.5 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  37.79 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  39.13 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  33.01 
 
 		 312 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  37.15 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  37 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  32.35 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  32.06 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  33.9 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  35.07 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  33.02 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  33.33 
 
 		 1178 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  33.02 
 
 		 724 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  30.69 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  31.35 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  28.73 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  28.11 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  31.5 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  27.83 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  34.95 
 
 		 180 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  31 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  30.75 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  30.55 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  30.26 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  32.33 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  30.06 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  29.85 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  32.91 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  30.3 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  28.96 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  29.29 
 
 		 714 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  32.89 
 
 		 496 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  33.05 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 		 490 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  35.68 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  27.04 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  28.02 
 
 		 394 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  35.96 
 
 		 489 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  32.46 
 
 		 433 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  31.58 
 
 		 440 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.3 
 
 		 385 aa  96.3  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  30.8 
 
 		 496 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  26.48 
 
 		 425 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  31.11 
 
 		 491 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  27.39 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  27.53 
 
 		 382 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  29.82 
 
 		 488 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  26.45 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  32.3 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  28.32 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  24.92 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  30.77 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  29.82 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  24.35 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  28.95 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  26.29 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  23.81 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  24.8 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  25.47 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  22.94 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  22.94 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>