19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0144 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
334 aa  679    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  100 
 
 
334 aa  679    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  44.65 
 
 
350 aa  271  9e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1153  glycosidase, PH1107-related  38.22 
 
 
353 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0153392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  25.52 
 
 
302 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  25.08 
 
 
724 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  24.07 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  27.13 
 
 
491 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  32 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  25.58 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  21.41 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  22.94 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  23.78 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  24.75 
 
 
297 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  28.46 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  28.32 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  26.05 
 
 
496 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  23 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  27.01 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>