91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2505 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
317 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  77.67 
 
 
320 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  61.18 
 
 
319 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  52.23 
 
 
330 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  55.84 
 
 
329 aa  340  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  51.61 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  50.49 
 
 
344 aa  319  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  48.52 
 
 
320 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  47.73 
 
 
316 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  50.83 
 
 
340 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  38.54 
 
 
294 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  39.67 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  39.34 
 
 
296 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  35.88 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  41.29 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  35.22 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  33.22 
 
 
332 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  35.18 
 
 
329 aa  178  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  39.69 
 
 
351 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  39.69 
 
 
351 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  39.69 
 
 
351 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  32.13 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  33.52 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  37.18 
 
 
357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  32.13 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  34.75 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  33.44 
 
 
331 aa  172  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  33.89 
 
 
352 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  33 
 
 
340 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  30.84 
 
 
312 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  32.34 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  33.33 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  31.93 
 
 
352 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  35.67 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  39.17 
 
 
724 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  30.19 
 
 
338 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  30.49 
 
 
321 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  37.5 
 
 
328 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  30.74 
 
 
296 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  30.1 
 
 
297 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  31.41 
 
 
302 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  31.6 
 
 
1178 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  30.46 
 
 
328 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  30.36 
 
 
373 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  30.55 
 
 
353 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  32.23 
 
 
363 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  27.11 
 
 
332 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  31.75 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  28.03 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  30.23 
 
 
373 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  35.06 
 
 
180 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  29.53 
 
 
425 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  29.47 
 
 
395 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.23 
 
 
385 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  31.67 
 
 
364 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  30.1 
 
 
400 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  27.62 
 
 
394 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  31 
 
 
323 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  31.44 
 
 
496 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  35.53 
 
 
496 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  27.72 
 
 
396 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  30.29 
 
 
343 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  32.75 
 
 
433 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  28.04 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  26.96 
 
 
396 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  34.2 
 
 
481 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  30.34 
 
 
437 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  27.76 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  30.12 
 
 
382 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  32.7 
 
 
430 aa  92.4  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  27.33 
 
 
345 aa  92.4  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  31.36 
 
 
433 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  28.49 
 
 
714 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  34.51 
 
 
491 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  32.47 
 
 
488 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  27.88 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  34.58 
 
 
505 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  31.11 
 
 
440 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  32.14 
 
 
490 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  31.88 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  31.87 
 
 
489 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  28.66 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  29.71 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  30.74 
 
 
506 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  31.06 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  27.03 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  24.03 
 
 
561 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  29.53 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  22.58 
 
 
350 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  27.01 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  27.01 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>