87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1013 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  100 
 
 
312 aa  644    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  75.16 
 
 
328 aa  501  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  72.99 
 
 
331 aa  484  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  69.03 
 
 
332 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  68.49 
 
 
318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  62.42 
 
 
321 aa  414  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  62.66 
 
 
338 aa  412  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  60.58 
 
 
326 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  60.26 
 
 
326 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  54.66 
 
 
329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  52.24 
 
 
336 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  50.8 
 
 
340 aa  335  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  41.23 
 
 
316 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  39.23 
 
 
329 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  34.19 
 
 
330 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  35.6 
 
 
318 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  33.77 
 
 
319 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  33.87 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  30.84 
 
 
317 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  33.01 
 
 
344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  32.79 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  37.39 
 
 
351 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  37.39 
 
 
351 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  37.39 
 
 
351 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  37.6 
 
 
355 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  33.44 
 
 
294 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  37.1 
 
 
352 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  35.34 
 
 
349 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  33.83 
 
 
354 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  35.85 
 
 
343 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  36.33 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  33.33 
 
 
724 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  31.07 
 
 
296 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  32.89 
 
 
296 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  32.56 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  37.9 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  37.61 
 
 
355 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  30.07 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  29 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  29.97 
 
 
297 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  39.6 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  37.79 
 
 
433 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  35.1 
 
 
359 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  26.91 
 
 
328 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  30.49 
 
 
1178 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  29.01 
 
 
396 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  28.21 
 
 
393 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  37.21 
 
 
496 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  27.61 
 
 
328 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  35.98 
 
 
489 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  38.24 
 
 
433 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  28.92 
 
 
400 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  31.1 
 
 
363 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  33.62 
 
 
425 aa  99.4  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  28.09 
 
 
394 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  40.13 
 
 
481 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  39.05 
 
 
488 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  27.22 
 
 
343 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  29.74 
 
 
395 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  35.76 
 
 
490 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  32.92 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  32.46 
 
 
437 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  36.05 
 
 
491 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  33.18 
 
 
496 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  34.55 
 
 
440 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  34.5 
 
 
714 aa  89.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  26.92 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  28.99 
 
 
430 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  32.54 
 
 
490 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27.24 
 
 
396 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  34.91 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  29.17 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  26.59 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  25.84 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  31.77 
 
 
505 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.83 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  23.55 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  32.12 
 
 
506 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  25.16 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  30.57 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  22.58 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  22.78 
 
 
382 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  23.08 
 
 
374 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  21.36 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  21.18 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  25.38 
 
 
379 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  27.49 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>