79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2308 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
425 aa  886    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  58.93 
 
 
396 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  59.29 
 
 
400 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  58.29 
 
 
395 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  55.78 
 
 
394 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  57.14 
 
 
393 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  56.04 
 
 
396 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  30.26 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  29.53 
 
 
317 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  29.3 
 
 
316 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  30.72 
 
 
329 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  32.47 
 
 
330 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  29.08 
 
 
320 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  30.49 
 
 
326 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  29.57 
 
 
331 aa  99.8  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  27.67 
 
 
318 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  33.62 
 
 
312 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  30.51 
 
 
326 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  24.85 
 
 
320 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  26.61 
 
 
344 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  32.37 
 
 
338 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  29.01 
 
 
294 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  32.62 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  32.08 
 
 
318 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  29.44 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  27.74 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  28.1 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  25.9 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  30.68 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  25.61 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  27.84 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  27.99 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  27.67 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  28.57 
 
 
496 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  28.97 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  28.78 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  25 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  30.15 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  27.72 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  26.77 
 
 
1178 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  27.34 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  25.6 
 
 
724 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  26.48 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  26.86 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  27.14 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  29.17 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  27.57 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  27.07 
 
 
302 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  29.7 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  29.7 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  29.7 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  27.4 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  23.42 
 
 
332 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  34.4 
 
 
714 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  28.64 
 
 
492 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  27.49 
 
 
296 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  29.12 
 
 
359 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  29.94 
 
 
489 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  27.93 
 
 
352 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  29.9 
 
 
355 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  27.64 
 
 
496 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  24.16 
 
 
297 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  28.25 
 
 
481 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  27.98 
 
 
506 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  25.81 
 
 
490 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  28.42 
 
 
343 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  30 
 
 
490 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  27.81 
 
 
180 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  30.18 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  25.42 
 
 
328 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  30 
 
 
353 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  31.3 
 
 
373 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  24.74 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  26.56 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  22.95 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  23.69 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  25.58 
 
 
345 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  22.44 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>