81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2440 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 		 400 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  66.84 
 
 		 395 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  66.15 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  65.3 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  61.54 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  64.43 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  59.79 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  31.49 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  29.08 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  31.63 
 
 		 316 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  31.16 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  30.3 
 
 		 318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  30.09 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  30.63 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  31.76 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  31.45 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  30.1 
 
 		 317 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  30.3 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  30.23 
 
 		 318 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  29.93 
 
 		 319 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  28.92 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  30.03 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  28.35 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  29.18 
 
 		 332 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  29.34 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  29.54 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  29.39 
 
 		 294 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  28.57 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  28.89 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  28.2 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  27.49 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  28 
 
 		 724 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  26.75 
 
 		 1178 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  24.29 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  27.96 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  27.15 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  27.59 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  26.5 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  27.85 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  29.63 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  25.62 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  26.3 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  25.87 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  34.4 
 
 		 714 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  23.34 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  26.69 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  25.71 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  27.14 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  27.6 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  25.74 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  26.44 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  26.44 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  24.39 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  26.44 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  28.07 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  29.14 
 
 		 180 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  26.27 
 
 		 363 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  24.75 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  34.88 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  30.53 
 
 		 489 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  30.51 
 
 		 353 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  23.03 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  26.74 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  33.86 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  26.98 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  31.82 
 
 		 343 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  26.02 
 
 		 496 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  28.3 
 
 		 492 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  25.54 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  27.22 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  36.7 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  26.98 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  28.09 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  32.38 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  27.23 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  24.74 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  25.81 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  21.72 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  26.07 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  21.86 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  23.2 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>