78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0507 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  819    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  64.43 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  62.76 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  64.43 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  63.14 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  63.12 
 
 		 395 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  57.14 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  29.65 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  30.29 
 
 		 330 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  30.12 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  28.74 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  28.61 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  29 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  28.23 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  28.57 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  28.45 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  28.26 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  26.44 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  28.75 
 
 		 328 aa  99.8  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  27.41 
 
 		 320 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  26.79 
 
 		 318 aa  97.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  26.94 
 
 		 319 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  27.19 
 
 		 321 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  28.03 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  28.09 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  28.53 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  26.97 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  26.22 
 
 		 340 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  27.18 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  26.9 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  27.24 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  27.04 
 
 		 1178 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  26.32 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  23.72 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  25.59 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  28.05 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  23.2 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  25.67 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  25.17 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  27.17 
 
 		 724 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  26.62 
 
 		 351 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  26.62 
 
 		 351 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  26.62 
 
 		 351 aa  67  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  31.72 
 
 		 714 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  26.75 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  30.95 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  25.15 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  24.5 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  27.23 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  24.63 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  26.56 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  26.78 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  26.84 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  30.16 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  25.53 
 
 		 180 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  32.31 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  22.97 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  25.14 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  31.88 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  25.09 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  24.12 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  24.81 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  28.49 
 
 		 481 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  24.85 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  25.56 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  24.29 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  26.8 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  25.28 
 
 		 506 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  28.23 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  27.42 
 
 		 490 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  25.13 
 
 		 488 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  28.81 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  27.75 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  22.6 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  24.04 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  22.22 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  24.43 
 
 		 491 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  27.87 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>