83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04900 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  100 
 
 		 345 aa  707    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  80.19 
 
 		 323 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  43.22 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  39.41 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  36.73 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  38.19 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  37.5 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  34.09 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  34.88 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  33.11 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  34.69 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  34.01 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  34.19 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  31.21 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  30.92 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  31.46 
 
 		 1178 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  27.69 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  28.13 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  31.54 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  29.82 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  29.6 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  27.58 
 
 		 724 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  27.54 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  26.92 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  30.38 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  30.38 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  28.96 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  26.42 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  27.04 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  28.17 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  26.54 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  29.94 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  26.54 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  26.54 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  28.71 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  28.57 
 
 		 561 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  27.33 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  26.72 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  26.44 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  25.33 
 
 		 357 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  28.83 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  26.09 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  25.62 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  26.57 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  26.48 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  29.41 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  26.4 
 
 		 714 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  26.1 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  26.52 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  25.95 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  25.8 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  25.91 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  28.27 
 
 		 433 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  26.57 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  23.55 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  24.15 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  27.12 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  27.05 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  24.6 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  26.91 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  27.65 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  27.76 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  23.93 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  30.43 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  28.76 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  25.75 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  27.18 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  26.69 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  22.51 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  28.93 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  26.83 
 
 		 492 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  27.53 
 
 		 490 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  25.63 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  24.69 
 
 		 488 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  24.02 
 
 		 675 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  25.23 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15480  hypothetical protein  29.06 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.857136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.97 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  24.7 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  23.14 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  25.68 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2296  hypothetical protein  28.32 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  25 
 
 		 481 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>