43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5767 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
561 aa  1148    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  50.54 
 
 
948 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  33.23 
 
 
328 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  29.89 
 
 
328 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  43.92 
 
 
1426 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  27.35 
 
 
364 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  28.92 
 
 
323 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  25.45 
 
 
374 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  41.96 
 
 
1427 aa  98.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  25.56 
 
 
382 aa  97.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  26.23 
 
 
297 aa  94.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  33.84 
 
 
1124 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  27.91 
 
 
345 aa  94  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  26.32 
 
 
302 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  34.6 
 
 
707 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  40.43 
 
 
1322 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  41.55 
 
 
1422 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  25.16 
 
 
296 aa  90.9  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  29.47 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  28.15 
 
 
296 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  26.44 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  26.82 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  25.15 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  23.78 
 
 
316 aa  63.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  25.72 
 
 
343 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  24.03 
 
 
317 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  25.09 
 
 
354 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  25.8 
 
 
343 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  23.97 
 
 
320 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  32.17 
 
 
675 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  31.87 
 
 
1114 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  41.38 
 
 
724 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  32.26 
 
 
332 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  24.34 
 
 
349 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  27.34 
 
 
1010 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  50.94 
 
 
319 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15480  hypothetical protein  38.2 
 
 
508 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.857136  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  33.68 
 
 
1178 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  30.05 
 
 
304 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  41.67 
 
 
351 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  41.67 
 
 
351 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  41.67 
 
 
351 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>