90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4136 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  100 
 
 
332 aa  685    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  51.76 
 
 
359 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  34.44 
 
 
343 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  30.79 
 
 
724 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  35.8 
 
 
302 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  33.44 
 
 
296 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  32.03 
 
 
294 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  32.15 
 
 
1178 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  31.23 
 
 
329 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  32.9 
 
 
296 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  32.26 
 
 
296 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  30.29 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  30.43 
 
 
297 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  31.19 
 
 
355 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  30.95 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  29.25 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  31.33 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  28.42 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  32.18 
 
 
352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  28.57 
 
 
330 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  29.17 
 
 
355 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  27.16 
 
 
320 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  31.6 
 
 
351 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  31.6 
 
 
351 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  31.6 
 
 
351 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  30.72 
 
 
328 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  29.79 
 
 
364 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  29.04 
 
 
320 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  31.83 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  29.25 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  27.11 
 
 
317 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  25.15 
 
 
319 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  32.41 
 
 
496 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  28.65 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  28.05 
 
 
714 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  32.13 
 
 
326 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  27.83 
 
 
344 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  30.3 
 
 
353 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  32.71 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  31.58 
 
 
326 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  29.93 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  32.37 
 
 
492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  27.9 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  30.24 
 
 
382 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  28.57 
 
 
323 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  32.48 
 
 
490 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  30.89 
 
 
340 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  28.71 
 
 
329 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  28.79 
 
 
496 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  29.97 
 
 
373 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  29.44 
 
 
376 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  32.39 
 
 
321 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  31.54 
 
 
338 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  32.84 
 
 
180 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  28.49 
 
 
373 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  31.5 
 
 
488 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  30.86 
 
 
332 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  27.7 
 
 
433 aa  99.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  30.48 
 
 
505 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  30.87 
 
 
331 aa  99.4  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  28.17 
 
 
345 aa  99.4  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  30.34 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  29.3 
 
 
491 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  27.67 
 
 
342 aa  97.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  27.67 
 
 
430 aa  96.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  32.92 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  29.82 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  29.24 
 
 
433 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  32.91 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  31.39 
 
 
489 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  30.58 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  26.49 
 
 
437 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  26.97 
 
 
506 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  23.91 
 
 
340 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  28.24 
 
 
494 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  27.33 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  27.33 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  24.68 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  23.72 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  24.6 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  23.73 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  25 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  25.39 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  25.83 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  23.44 
 
 
425 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  23.26 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  26.42 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  25.86 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  32.26 
 
 
561 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0974  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.06 
 
 
545 aa  42.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>