79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5159 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
490 aa  1016    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  53.81 
 
 
488 aa  542  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  52.58 
 
 
492 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  48.94 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  46.3 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  45.29 
 
 
490 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  46.01 
 
 
489 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  44.21 
 
 
496 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  39.92 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  39.84 
 
 
505 aa  353  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  41.86 
 
 
491 aa  352  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  40.17 
 
 
494 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  36.46 
 
 
506 aa  316  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  55.36 
 
 
433 aa  274  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  52.14 
 
 
433 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  46.96 
 
 
440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  44.83 
 
 
430 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  33.83 
 
 
354 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  30.56 
 
 
351 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  30.56 
 
 
351 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  30.56 
 
 
351 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  31.33 
 
 
355 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  30.92 
 
 
349 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  33.18 
 
 
296 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  32.48 
 
 
332 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  34.36 
 
 
316 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  32.88 
 
 
297 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  31.45 
 
 
343 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  31.47 
 
 
352 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  34.2 
 
 
296 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  34.2 
 
 
296 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  32 
 
 
302 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  31.86 
 
 
294 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  31.42 
 
 
352 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  39.72 
 
 
180 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  29.96 
 
 
724 aa  97.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  29.47 
 
 
329 aa  97.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  27.92 
 
 
359 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  30.9 
 
 
355 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  34.05 
 
 
330 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  32.54 
 
 
312 aa  87.8  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  31.05 
 
 
1178 aa  87.4  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  31.03 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  31.42 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  31.65 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  29.65 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  28.42 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  31.02 
 
 
714 aa  81.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  29.05 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  30.43 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  31.6 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  30.09 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  30.28 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  31.6 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  29.71 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  28.32 
 
 
344 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  30.41 
 
 
338 aa  77  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  28.23 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  30.81 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  29.49 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  29.26 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  29.8 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  28.68 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  30.37 
 
 
331 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  29.15 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32.65 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  28.57 
 
 
393 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  30 
 
 
425 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  27.82 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  29.32 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  28.23 
 
 
343 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  25.76 
 
 
395 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  27.53 
 
 
345 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  24.88 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2570  hypothetical protein  34.48 
 
 
307 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410716  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  27.08 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  25.22 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  24.42 
 
 
373 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  26.53 
 
 
400 aa  43.5  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>