90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2614 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 		 329 aa  660    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  55.56 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  54.43 
 
 		 320 aa  361  8e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  55.88 
 
 		 318 aa  355  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  55.08 
 
 		 344 aa  352  7e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  55.66 
 
 		 320 aa  351  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  57.69 
 
 		 319 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  55.84 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  50.49 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  43.69 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  42.24 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  42.24 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  39.23 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  41.5 
 
 		 332 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  39.3 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  39.94 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  39.55 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  43.01 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  40.33 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  39.17 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  41.67 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  41.11 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  41.11 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  41.11 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  40.3 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  38.91 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  37.82 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  36.89 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  39.66 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  34.07 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  39.41 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  38.41 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  38.76 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  36.46 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  39.29 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  35.71 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  38.77 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  42.39 
 
 		 724 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  35.44 
 
 		 1178 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  37.74 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  34.41 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  31.23 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  33.91 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  32.45 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  39.04 
 
 		 180 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  30.57 
 
 		 359 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  31.55 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  34.62 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  31.49 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  36.84 
 
 		 496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  36.96 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  30.26 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  32.45 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32.19 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  29.97 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  34.21 
 
 		 491 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  35.37 
 
 		 496 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  35.4 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  28.34 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  35.9 
 
 		 430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  28.53 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  28.94 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  31.94 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  32.8 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27.06 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  36.4 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  31.53 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  34.63 
 
 		 488 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  29.65 
 
 		 714 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  28.96 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  29.59 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  34.33 
 
 		 481 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  34.07 
 
 		 490 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  28.86 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  30.38 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  33.92 
 
 		 492 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  33.69 
 
 		 505 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  29.47 
 
 		 490 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  27.08 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  34.8 
 
 		 489 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  32.24 
 
 		 506 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  30.47 
 
 		 367 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  36.36 
 
 		 494 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  29.06 
 
 		 374 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  28.12 
 
 		 382 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  29.12 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  31.15 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  22.55 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  23 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  23 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>