89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3439 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  100 
 
 
319 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  62.38 
 
 
320 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  61.18 
 
 
317 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  57.69 
 
 
329 aa  345  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  50 
 
 
330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  51.64 
 
 
318 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  46.47 
 
 
320 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  47.57 
 
 
316 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  47.88 
 
 
344 aa  288  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  48.69 
 
 
340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  36.39 
 
 
326 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  36.39 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  39.09 
 
 
294 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  36.88 
 
 
332 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  35.29 
 
 
354 aa  185  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  38.84 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  35.55 
 
 
331 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  34.55 
 
 
318 aa  178  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  33.77 
 
 
312 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  35.08 
 
 
336 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  36.97 
 
 
328 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  37.5 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  33.01 
 
 
321 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  40.62 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  39.06 
 
 
357 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  31.18 
 
 
352 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  35.97 
 
 
296 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  32.01 
 
 
340 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  35.83 
 
 
329 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  32.12 
 
 
338 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  38.49 
 
 
351 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  38.49 
 
 
351 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  38.49 
 
 
351 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  35.31 
 
 
296 aa  165  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  37.97 
 
 
724 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  35.94 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  32.58 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  36.63 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  36.09 
 
 
355 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  33.46 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32.19 
 
 
353 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  28.49 
 
 
359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  31.23 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  30.8 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  30.88 
 
 
373 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  38.73 
 
 
180 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  32.92 
 
 
1178 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  32.83 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  36.68 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  25.15 
 
 
332 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  35.62 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  28.76 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  33.83 
 
 
363 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  35.22 
 
 
496 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  30.03 
 
 
714 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  29.93 
 
 
400 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  28.49 
 
 
385 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  34.32 
 
 
433 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  37.5 
 
 
489 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  34.48 
 
 
491 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  34.53 
 
 
433 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  30.86 
 
 
496 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  28.15 
 
 
394 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  29 
 
 
437 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  34.03 
 
 
440 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  26.94 
 
 
393 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  32.91 
 
 
490 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  33.18 
 
 
481 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  27.09 
 
 
395 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  30.55 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  30.25 
 
 
488 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  29.74 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  24.56 
 
 
396 aa  85.9  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  27.87 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  33.78 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  34.08 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  32.16 
 
 
492 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  25.9 
 
 
425 aa  82.8  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  28.42 
 
 
490 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  25.82 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  28.89 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  32.92 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  32.56 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  24.77 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  26.1 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  26.73 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  28.5 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  50.94 
 
 
561 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  23.56 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>