90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3112 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  100 
 
 		 330 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  59.87 
 
 		 320 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  58.28 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  55.56 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  54.72 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  53.9 
 
 		 320 aa  355  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  52.23 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  50 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  51.16 
 
 		 316 aa  325  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  38.96 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  37.17 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  36.57 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  36.96 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  36.63 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  36.27 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  36.54 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  36.6 
 
 		 318 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  35.26 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  40.91 
 
 		 294 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  33.77 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  34.19 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  32.69 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  40.65 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  35.18 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  41.7 
 
 		 354 aa  185  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  40 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  34.91 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  39.6 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  39.69 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  39.69 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  39.69 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  37.18 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  41.31 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  34.46 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  37.66 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  33.99 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  30.47 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  34.09 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  36.76 
 
 		 724 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  33.77 
 
 		 297 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  35.58 
 
 		 1178 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  32.03 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  30.31 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  39.08 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  30.33 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  31.53 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  28.57 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  36.96 
 
 		 496 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  31.93 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.03 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  29.24 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  29.72 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  30.86 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  31.97 
 
 		 396 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  28.93 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  28.78 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  29.59 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  31.37 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  30.85 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  32.47 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  30.46 
 
 		 714 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  33.46 
 
 		 437 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  35.37 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  30.84 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  29.6 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  35.87 
 
 		 481 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  33.62 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  28.04 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  28.53 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  29.93 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  34.04 
 
 		 492 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  31.36 
 
 		 488 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  31.62 
 
 		 496 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  29.52 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  31.6 
 
 		 491 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  35.43 
 
 		 489 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  31.74 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  30.3 
 
 		 490 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  34.05 
 
 		 490 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  32.08 
 
 		 505 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  28.34 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  26.23 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  30.59 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  29.96 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  25.68 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  28.86 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  25.58 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  25.58 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  26.7 
 
 		 379 aa  45.8  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  22.7 
 
 		 561 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>