87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1718 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  100 
 
 		 318 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  74.21 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  69.28 
 
 		 328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  71.2 
 
 		 331 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  68.49 
 
 		 312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  66.14 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  63.44 
 
 		 321 aa  431  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  58.44 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  59.06 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  58.75 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  55.52 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  54.09 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  41.29 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  39.94 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  36.6 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  34.63 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  33.88 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  34.55 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  33 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  32.13 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  35 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  35.05 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  36.72 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  38.03 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  39.44 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  38.03 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  38.03 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  35.97 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  34.47 
 
 		 355 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  34.96 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  37.56 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  33.96 
 
 		 724 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  29.81 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  37.67 
 
 		 355 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  30.97 
 
 		 340 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  33.7 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  30.32 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  36.57 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  33.7 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  30.43 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  30.03 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  32.71 
 
 		 1178 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  30.1 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  38.41 
 
 		 180 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  30.59 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  30.91 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  29.94 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  34.12 
 
 		 433 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  36.78 
 
 		 496 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  36.23 
 
 		 491 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  35.1 
 
 		 496 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  27.6 
 
 		 395 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  28.57 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  30.98 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  34.13 
 
 		 437 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  32.6 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  32.91 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  31.1 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  26.79 
 
 		 393 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  31.53 
 
 		 396 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  33.94 
 
 		 489 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  40.13 
 
 		 481 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27.41 
 
 		 396 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  34.16 
 
 		 714 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  27.45 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  30.23 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  34.38 
 
 		 488 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  35.88 
 
 		 490 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  32.08 
 
 		 425 aa  85.9  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  28.05 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  31.35 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  37.5 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  35.63 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  34.32 
 
 		 506 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  33.92 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  30.09 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  31.53 
 
 		 430 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  25.8 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  28.19 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  25.63 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  25.57 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  23.91 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  23.64 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  23.99 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  32 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  32 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  29.03 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>