85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2313 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  100 
 
 
329 aa  683    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  58.7 
 
 
332 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  58.36 
 
 
331 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  57.36 
 
 
326 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  57.06 
 
 
326 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  57.54 
 
 
328 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  53.23 
 
 
340 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  53.09 
 
 
336 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  55.52 
 
 
318 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  54.66 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  53.58 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  50.31 
 
 
321 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  34.91 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  33.97 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  35.18 
 
 
317 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  38.41 
 
 
329 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  34.2 
 
 
320 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  35.83 
 
 
319 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  36.12 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  39.02 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  39.02 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  39.02 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  36.4 
 
 
354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  32.06 
 
 
344 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  33.76 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  35.66 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  34.75 
 
 
357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  33.98 
 
 
352 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  31.48 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  30.21 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  30.8 
 
 
296 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  34.21 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  34.59 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  33.95 
 
 
343 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  34.22 
 
 
724 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  31.8 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  31.8 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  29.09 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  27.78 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  28.57 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  30.91 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  27.36 
 
 
396 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  32.06 
 
 
302 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  26.92 
 
 
395 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  28.71 
 
 
332 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  27.69 
 
 
394 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  32.03 
 
 
363 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  29.75 
 
 
359 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  33.53 
 
 
180 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  28.75 
 
 
396 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  28.67 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  26.48 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  33.01 
 
 
496 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  28.16 
 
 
1178 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  30.14 
 
 
433 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  27.22 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  32.83 
 
 
433 aa  89.7  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  36.04 
 
 
437 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  34.78 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  33.5 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  24.8 
 
 
714 aa  82.4  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  31.61 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  26.48 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  26.84 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  33.71 
 
 
496 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  29.96 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  31.07 
 
 
492 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  28.79 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  28.23 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  35 
 
 
491 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  37.11 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  26.4 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  27.06 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.77 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  27.73 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  27.34 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  24 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  28.57 
 
 
430 aa  66.2  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  24.72 
 
 
373 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  34.07 
 
 
494 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  30.73 
 
 
505 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  24.64 
 
 
367 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  23.24 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  27.85 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>