101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0947 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  100 
 
 
296 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  98.31 
 
 
296 aa  603  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0764  glycosidase, PH1107-related  74.24 
 
 
294 aa  455  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  51.97 
 
 
302 aa  291  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1788  glycosidase, PH1107-related  49.33 
 
 
296 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  47.32 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  45 
 
 
1178 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2615  glycosidase PH1107-related protein  39.29 
 
 
724 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0362  glycosidase PH1107-related protein  40 
 
 
343 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0679  glycosidase PH1107-related  43.62 
 
 
316 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000013124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0916  glycosidase, PH1107-related  40.48 
 
 
328 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7534  glycosidase PH1107-related  40.39 
 
 
320 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1462  glycosidase PH1107-related  43.32 
 
 
355 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1733  hypothetical protein  43.09 
 
 
351 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625558  hitchhiker  0.000641846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1530  hypothetical protein  43.09 
 
 
351 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1637  glycosidase PH1107-related  43.09 
 
 
351 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3112  glycosidase, PH1107-related  39.61 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.204861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1138  glycosidase PH1107-related  42.11 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0718  glycosidase PH1107-related protein  36.81 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0779559  normal  0.015254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2505  glycosidase PH1107-related  39.34 
 
 
317 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0285  glycosidase PH1107-related  39.8 
 
 
318 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00104033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2776  hypothetical protein  38.87 
 
 
320 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.0192605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0319  glycosidase PH1107-related  41.3 
 
 
349 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3362  glycosidase PH1107-related protein  42.51 
 
 
352 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1802  glycosidase, PH1107-related  53.59 
 
 
180 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2614  glycosidase PH1107-related protein  38.76 
 
 
329 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2271  glycosidase PH1107-related protein  35.37 
 
 
323 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0768  glycosidase PH1107-related protein  42.02 
 
 
357 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3439  glycosidase PH1107-related protein  36.42 
 
 
319 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3139  hypothetical protein  37.46 
 
 
344 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0190323  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04900  predicted glycosylase  34.01 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1722  glycosidase PH1107-related  38.46 
 
 
355 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000791852  decreased coverage  0.0000765137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0658  glycosidase PH1107-related  33.88 
 
 
714 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4004  glycosidase PH1107-related  37.07 
 
 
352 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00339526  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4136  glycosidase, PH1107-related  32.9 
 
 
332 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.681025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4311  glycosidase, PH1107-related  32.72 
 
 
359 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3919  glycosidase PH1107-related protein  33.55 
 
 
364 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.280245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3001  glycosidase PH1107-related  33.99 
 
 
336 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.345013  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1593  glycosidase PH1107-related  36.27 
 
 
326 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.107224  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1543  glycosidase, PH1107-related  35.95 
 
 
326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1163  glycosidase PH1107-related protein  38.26 
 
 
496 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6814  glycosidase PH1107-related  32.43 
 
 
343 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1054  glycosidase, PH1107-related  34.73 
 
 
496 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1013  glycosidase, PH1107-related  32.89 
 
 
312 aa  142  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0687  glycosidase PH1107-related  33.88 
 
 
338 aa  142  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33021  predicted protein  31.15 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6158  glycosidase PH1107-related  31.5 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.907204  normal  0.17294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5214  glycosidase, PH1107-related  37.39 
 
 
491 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537659  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0363  glycosidase PH1107-related protein  30.55 
 
 
370 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3437  glycosidase PH1107-related protein  31.07 
 
 
340 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.874015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2034  glycosidase, PH1107-related  31.37 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.92471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2264  glycosidase PH1107-related  33.44 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1061  glycosidase PH1107-related  36.24 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0491073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0204  glycosidase PH1107-related protein  32.73 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1800  glycosidase PH1107-related  33 
 
 
331 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0994449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0864  glycosidase, PH1107-related  36.91 
 
 
489 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0859  glycosidase PH1107-related protein  34.48 
 
 
373 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3892  glycosidase, PH1107-related protein  33.33 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1718  glycosidase PH1107-related  33.68 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2313  glycosidase PH1107-related  31.8 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.109777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3176  glycosidase PH1107-related  30.49 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4368  glycosidase, PH1107-related  31.71 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5322  glycosylase  32.22 
 
 
437 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0926  glycosidase  29.26 
 
 
433 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.236704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2555  glycosidase PH1107-related  33.11 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1454  glycosidase PH1107-related  38.16 
 
 
492 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0891  glycosidase PH1107-related  32.45 
 
 
332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1237  glycosidase PH1107-related  32.66 
 
 
490 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.678799  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5605  glycosidase PH1107-related  37.12 
 
 
481 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320186  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0171  glycosidase, PH1107-related  36.82 
 
 
488 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0126  hypothetical protein  30.95 
 
 
376 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3374  glycosidase PH1107-related protien  32.68 
 
 
494 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000228446  hitchhiker  0.00648646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2576  glycosidase, PH1107-related  33.05 
 
 
440 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44608  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3324  glycosidase PH1107-related  34.8 
 
 
505 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0741  glycosidase, PH1107-related  33.19 
 
 
430 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5159  glycosidase PH1107-related  34.2 
 
 
490 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0544  glycosidase PH1107-related  29.39 
 
 
506 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134151  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2025  hypothetical protein  30.39 
 
 
385 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2440  glycosidase PH1107-related protein  28.57 
 
 
400 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512548  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5274  glycosidase PH1107-related  28.31 
 
 
367 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1008  hypothetical protein  30.16 
 
 
379 aa  99.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  29.47 
 
 
561 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4955  glycosidase, PH1107-related  28.72 
 
 
396 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0357227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5397  glycosidase PH1107-related  27.36 
 
 
394 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392278  normal  0.225601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0507  hypothetical protein  26.55 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00187028  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2308  glycosidase PH1107-related  27.67 
 
 
425 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0157258  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3003  glycosidase PH1107-related  25.91 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.87538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3984  glycosidase PH1107-related  26.54 
 
 
395 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0103  glycosidase PH1107-related  26.69 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.992856  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  27.13 
 
 
675 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  28.77 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  26.59 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0146  glycosidase, PH1107-related  23 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0144  glycosidase PH1107-related  23 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  30.51 
 
 
1597 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2078  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.19 
 
 
494 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  32.08 
 
 
1708 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2114  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.19 
 
 
494 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.47 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  29.31 
 
 
331 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>