22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2565 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  41.19 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  37.23 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  36.08 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  36.19 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  36.45 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  32.82 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  35.95 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  31.15 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  33.12 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  31.82 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  28.4 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  29.19 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  26.22 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0947  glycosidase, PH1107-related  28.77 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0964  glycosidase PH1107-related  27.4 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  26.91 
 
 		 1746 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  26.95 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1059 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  25.69 
 
 		 1597 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  25.35 
 
 		 1708 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>