19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3839 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  51.28 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  43.53 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  39.81 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  41.8 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  33.01 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  37.3 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  34.29 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  31.97 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  32.5 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  31.94 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  27.8 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  31.38 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  31.15 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  25.78 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1059 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  27.78 
 
 		 1746 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  25.34 
 
 		 1597 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1368  hypothetical protein  23.97 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.553065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>