15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00205 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  41.5 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  34.85 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  35.19 
 
 
319 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  31.27 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  32.17 
 
 
315 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  32.68 
 
 
307 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  30.28 
 
 
319 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  30.98 
 
 
311 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  28.4 
 
 
322 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  30.07 
 
 
299 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  28.62 
 
 
313 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  28.18 
 
 
323 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  26.23 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  27.43 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>