22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2303 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  630  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  35.37 
 
 
319 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  34.85 
 
 
317 aa  185  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  33.77 
 
 
307 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  32.27 
 
 
315 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  29.55 
 
 
309 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  31.42 
 
 
311 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  32.82 
 
 
322 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  30.74 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  33.02 
 
 
323 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  30.82 
 
 
299 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  29.41 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  28.62 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  24.51 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  32.03 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  24.35 
 
 
1597 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  22.96 
 
 
1708 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  27.23 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  24.77 
 
 
1059 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  25.63 
 
 
1746 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.99 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_89632  predicted protein  27.27 
 
 
357 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.730848  hitchhiker  0.00000161673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>