22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11533 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  43.61 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  37.13 
 
 
319 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  36.91 
 
 
304 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  33.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  36.6 
 
 
307 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  35.03 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  33.97 
 
 
319 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  31.15 
 
 
322 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  30.82 
 
 
307 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  34.29 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  30.87 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  31.51 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  30.07 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  30.16 
 
 
316 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  26.87 
 
 
1597 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  27.97 
 
 
1708 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  29.05 
 
 
1746 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  22.8 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43831  predicted protein  31.85 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  30.57 
 
 
1332 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2758  hypothetical protein  26.53 
 
 
369 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00648558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>