21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2566 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  661    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  41.19 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  38.91 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  37.03 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  35.13 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  34.48 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  33.97 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  31.35 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  34.38 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  31.6 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  30.28 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  30.57 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  25.78 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1789  glycosidase, PH1107-related  23.75 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0536  glycosidase PH1107-related  22.22 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000479891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  24.77 
 
 		 1708 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  24.66 
 
 		 1597 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  26.19 
 
 		 1746 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.75 
 
 		 210 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>