21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3215 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  41.88 
 
 
309 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  41.67 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  43.51 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  37.13 
 
 
299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  37.03 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  37.5 
 
 
311 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  35.37 
 
 
307 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  36.45 
 
 
322 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  35.19 
 
 
317 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  35.99 
 
 
323 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  34.5 
 
 
313 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  30.97 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  27.69 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  31.06 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  24.55 
 
 
1597 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  24.31 
 
 
1746 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  22.64 
 
 
1059 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  29.32 
 
 
1708 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0433  hypothetical protein  22.33 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.233515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  29.93 
 
 
1332 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>