21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3317 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  43.61 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  34.5 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  35.58 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  29.21 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  34.38 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  30.39 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  30.82 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  28.62 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  30.82 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  28.62 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  30.96 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  28.34 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  29.18 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  28.09 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  27.82 
 
 		 1746 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  29.2 
 
 		 1597 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4320  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  22.71 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327535  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0433  hypothetical protein  29.46 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.233515  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_89632  predicted protein  28.57 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.730848  hitchhiker  0.00000161673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>