15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3426 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  41.5 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  30.74 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  30.97 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  30.87 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  30.16 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  27.8 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  25.81 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  28.34 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  29.41 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  26.22 
 
 		 322 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  24.14 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  23.75 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>