60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0471 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  73.43 
 
 		 1332 aa  1500    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  100 
 
 		 1059 aa  2113    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  50.78 
 
 		 1597 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  50.68 
 
 		 1708 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  48.04 
 
 		 1746 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  33.86 
 
 		 3471 aa  184  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  29.91 
 
 		 4896 aa  162  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  28.79 
 
 		 1293 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  29.58 
 
 		 983 aa  109  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  38.21 
 
 		 900 aa  106  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  28.17 
 
 		 2573 aa  105  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  31.02 
 
 		 3921 aa  104  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  27.4 
 
 		 744 aa  97.8  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1898 aa  94.7  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1441 aa  93.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  29.09 
 
 		 3602 aa  91.3  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30.26 
 
 		 1989 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  27.62 
 
 		 1118 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  26.73 
 
 		 4897 aa  82.4  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0809  laminin G, domain-containing 2  41.41 
 
 		 209 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.012094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  28.98 
 
 		 3394 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  29.52 
 
 		 574 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  42.2 
 
 		 1263 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1946 aa  70.1  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  31.49 
 
 		 1150 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  30.82 
 
 		 3911 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1227 aa  65.1  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  27.98 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  31.78 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1202 aa  61.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.98 
 
 		 3191 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3119  hypothetical protein  38.1 
 
 		 409 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  31.39 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  28.73 
 
 		 1168 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1537 aa  59.3  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  25.81 
 
 		 8918 aa  58.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  32.52 
 
 		 284 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  25.64 
 
 		 3634 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  36.36 
 
 		 304 aa  56.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  25.47 
 
 		 3771 aa  55.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1809 aa  54.3  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  26.17 
 
 		 309 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  31.54 
 
 		 621 aa  53.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  23.08 
 
 		 1519 aa  52  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  26.51 
 
 		 307 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  34.48 
 
 		 775 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3966  glycosyl hydrolase family 32 protein  38.46 
 
 		 505 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.953512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  49.7  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  27.66 
 
 		 2000 aa  49.7  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  30.25 
 
 		 304 aa  49.3  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  35.51 
 
 		 907 aa  48.9  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  24.77 
 
 		 307 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4916  hypothetical protein  25.17 
 
 		 283 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  21.77 
 
 		 3360 aa  46.2  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.81 
 
 		 2490 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.79 
 
 		 2490 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  37.5 
 
 		 827 aa  45.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  22.64 
 
 		 319 aa  45.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.29 
 
 		 2724 aa  45.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.01 
 
 		 2490 aa  44.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>