18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3119 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  837    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3462  hypothetical protein  41.58 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1332 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1227 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  34.34 
 
 		 900 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.93 
 
 		 4896 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1059 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1441 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  34.88 
 
 		 1263 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  33.65 
 
 		 3471 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1898 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  42 
 
 		 939 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  42 
 
 		 975 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  34.58 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  33.86 
 
 		 1118 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  30.61 
 
 		 3771 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  36.28 
 
 		 1989 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1202 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>