81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1176 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 1202 aa  2415    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  40.08 
 
 		 1227 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  28.54 
 
 		 3634 aa  207  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1537 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1809 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  25.43 
 
 		 3471 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.35 
 
 		 1293 aa  109  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 3921 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  29.27 
 
 		 2573 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  29.81 
 
 		 744 aa  101  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  25.64 
 
 		 4896 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  24.27 
 
 		 3602 aa  90.9  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1332 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  28.81 
 
 		 983 aa  78.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  25.69 
 
 		 2489 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.74 
 
 		 5010 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  28.93 
 
 		 1857 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  27.4 
 
 		 2520 aa  71.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  24.96 
 
 		 2121 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.16 
 
 		 1989 aa  69.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  30.23 
 
 		 5010 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  22.75 
 
 		 2490 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  29.43 
 
 		 5017 aa  65.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  21.09 
 
 		 2025 aa  65.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2520 aa  65.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  26.27 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  29.14 
 
 		 5017 aa  64.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  29.14 
 
 		 5017 aa  64.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  29.23 
 
 		 5010 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  27.71 
 
 		 2485 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  20.49 
 
 		 3521 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.18 
 
 		 5010 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  28.08 
 
 		 2487 aa  62.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27 
 
 		 2113 aa  62.4  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  26.26 
 
 		 1150 aa  62.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  28.86 
 
 		 5017 aa  62  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  28.73 
 
 		 2886 aa  62  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  34.71 
 
 		 726 aa  62  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.46 
 
 		 5017 aa  61.6  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  27.67 
 
 		 2358 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  27.67 
 
 		 2358 aa  61.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  27.26 
 
 		 1118 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  20.49 
 
 		 3471 aa  61.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.34 
 
 		 1519 aa  60.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  27.13 
 
 		 2490 aa  60.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  23.68 
 
 		 1168 aa  60.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  24.48 
 
 		 2490 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  27.36 
 
 		 2490 aa  59.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1059 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  27.39 
 
 		 2490 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.61 
 
 		 3409 aa  57  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  28.03 
 
 		 3394 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  26.76 
 
 		 845 aa  56.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  25.9 
 
 		 621 aa  56.2  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3558  hypothetical protein  62.86 
 
 		 269 aa  55.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  24.2 
 
 		 2490 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  21.11 
 
 		 3472 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  28.78 
 
 		 1533 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  45.83 
 
 		 801 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  47.06 
 
 		 826 aa  53.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  28.48 
 
 		 440 aa  52  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  45.24 
 
 		 827 aa  52  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  31.67 
 
 		 775 aa  51.6  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  25.98 
 
 		 807 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  25.49 
 
 		 3911 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3119  hypothetical protein  29.31 
 
 		 409 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.28 
 
 		 3191 aa  49.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  25.59 
 
 		 2912 aa  48.9  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1931  hypothetical protein  64.52 
 
 		 224 aa  48.5  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0367641  normal  0.0184449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5377  hypothetical protein  44.23 
 
 		 580 aa  48.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0233542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4916  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  30.87 
 
 		 924 aa  47  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  24.55 
 
 		 909 aa  47  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1038 aa  46.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  32.95 
 
 		 587 aa  46.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1264  conserved repeat domain protein  30.68 
 
 		 686 aa  46.2  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1624 aa  46.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2418  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1019 aa  46.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  25.89 
 
 		 4897 aa  45.8  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  26.62 
 
 		 2853 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  24.12 
 
 		 853 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>